1、目标元件，比如你的FPGA，须确保在原理图和PCB中是链接关系。可在project菜单下的component links里进行查看或链接。
在最右边的Matched Components里查找，若能找到FPGA的位号则表示已链接，若没有则可以根据上面的说明进行操作。
2、在project菜单下的project Options里的Options处，将changing schematic pins打勾。
下面开始具体步骤：
1、在PCB中双击FPGA，并将enable pin swaps选中，然后OK。
2、菜单tools->pin/part swapping->configure，进入配置界面。检查FPGA对应的pin swap处是否打勾，理论上第一步已打勾，这里应该已打勾。
在进入配置图前，可能会跳出一个警告“不是所有PCB元件已链接到原理图元件”，不用理会，只要FPGA已链接即可。3、在这个配置图里双击FPGA元件，进入pin swapping界面，会发现每个引脚出现3次，我们只要关注其中的任意一个就可以了。Ctrl+左击，选中可进行引脚转换的所有引脚（针对每个引脚，只需在三个里选其中一个即可），右击，选择assign pin swap groups by，子菜单下选type（本处不一定选type，只要让选中的引脚的pin group值一样且与其他引脚不一样即可。pin group值可手动改。）。4、下面就可以进行pin swap，可自动也可手动。指令为tools->pin/part swapping->automatic net/pin optimizer（自动）或interactive pin/net swapping（手动）。5、记得反向更新原理图，使PCB和原理图保持一致，并进行检查。
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